Ed Harris gerçeklik algısını değiştiren nöbetler geçiren Soğuk Savaş döneminde bir Sovyet misil denizaltının kaptanını canlandırıyor. Karısından ve kızından ayrılmak zorunda kalan kaptan gizli bir göreve katılır. Bu görev üzerindeyken dolandırıcı bir KGB grubu geminin nükleer füzenin kontrolünü ele geçirir. İnsanlığın kaderi kaptanın ellerindedir. Bu görev için özellikle seçildiğini fark eder ama başaramayacağını düşünmektedir. Phantom imkansız seçimlerle karşı karşıya kalan sıra dışı adamların hikayesini anlatan bir filmdir...