Artık süper kahramanların ve uzaylıların varlığı herkes tarafından bilinmektedir ve dünya bu yeni gerçekle yüzleşmeye çalışır. Ajan Phil Coulson tekrar harekete geçmiştir ve gözü Yükselen Gelgit adlı gizemli bir gruptadır. Bu görünmeyen ve bilinmeyen düşmanın izini sürmek için, dünya çapında kanun uygulayıcı bir organizasyon olan S.H.I.E.L.D. küçük ama son derece seçkin bir ajan grubu toplar. S.H.I.E.L.D. ekibinin bir görevi vardır: Olağan olanı olağanüstü olandan koruyarak tüm dünyada yeni, tuhaf ve bilinmeyen şeyleri araştırmak.