2071 Japonya’sında geçen hikâyede, Aragami olarak bilinen gizemli canavarlar tarafından dünya neredeyse yok edilmiştir. Fenrir isimli bir örgüt Aragamileri yok etmek için, gene onların hücrelerinden üretilmiş “God Arcs” isimli silahları kullanmaktadır. Aragamileri öldürmekte uzmanlaşmış olanlara verilen isim “God Eaters” ‘tır. Önceleri God Eaterlar sadece tek tip God Arcs kullanabiliyorlardı, bıçak yada silah modu. Ancak yeni keşfedilen bir tür ile bu iki silah tipi arasında geçiş yapılabilir hale gelindi. O günden beri yeni-tür ve eski-tür diye God Eaterlar ikiye ayrılıyorlar.